Un problème épistémologique au XVIIIè siècle est l'assimilation entre le potentiel et l'actuel, entre le figurant et le figuré, entre le tout et la partie. Ainsi, à la suite des expériences de Tremblay (1744) , les naturalistes considèrent-ils que la partie sectionnée à partir d'un être vivant (l'hydre) représente au sens fort l'individu d'où elle est issue dans la mesure où elle peut régénérer un nouvel être vivant, semblable au premier ; elle est aussi un vivant, certes encore élémentaire . De même la multiplication des représentations des espèces chez les naturalistes aboutit à confondre les représentants d'une espèce et leur représentation. Nous nous demanderons si l'usage des signes par les naturalistes au XVIIIè siècle n'est pas tributaire d'une forme de raisonnement qui s'est mise en place au XVIIè siècle, en particulier avec la Logique de Port-Royal. L'expression de ces nouvelles conditions épistémologiques aboutit à une logique de la représentation ou l'individu élémentaire peut être figure, représentant, de l'individu total ; même s'il ne le contient que potentiellement, il y sera assimilé. Dans la Logique de Port-Royal, Antoine Arnauld et Pierre Nicole écrivaient : " Quoiqu'une chose dans un état ne puisse être signe d'elle-même dans ce même état, quoique tout signe demande une distinction entre le chose représentante et celle qui est représentée, néanmoins, il est très possible qu'une chose dans un certain état se représente dans un autre état...et qu'ainsi la distinction d'état suffit entre la chose figurante et la chose figurée " . Ainsi, l'être existant potentiellement et l'être existant actuellement, sont vite confondus dans la même réalité. Nous interrogerons sur les conséquences de cette Logique dans l'établissement des systèmes de représentation au XVIIIè siècle.
