Le milieu régnant dans les réseaux d’assainissement est agressif pour les matériaux et notamment pour les matériaux cimentaires. La présence de sulfure de dihydrogène (H2S) va permettre le développement de bactéries sulfo-oxydantes qui vont oxyder les molécules soufrées en acide sulfurique qui va réagir avec les matériaux cimentaires pour former des matériaux sans consistance ou expansifs pouvant provoquer une rupture de la structure. Tous les matériaux n’ont pas la même résistance vis-à-vis de ce milieu. Ainsi les bétons à base de ciment d’aluminate de calcium présentent une meilleure résistance que les bétons à base de ciment Portland. Nous nous sommes intéressés à un des paramètres pouvant expliquer cette différence à savoir une différence de colonisation des mortiers par les espèces microbiennes. Des échantillons de mortiers à base des deux types de ciment ont été placés dans une enceinte recréant les conditions des réseaux d’assainissement puis observés au microscope à épifluorescence avec une coloration Live/Dead puis en microscopie électronique à balayage. Il a ainsi pu être mis en évidence que les mortiers à base de ciment d’aluminate de calcium présentent un plus faible développement microbien. Ceci peut être expliqué par la présence d’ions aluminium, inhibiteur de la croissance bactérienne, et par la modification des propriétés de surface des mortiers par la formation d’un gel d’alumine.